65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3949 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
178 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  98.31 
 
 
178 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  98.31 
 
 
178 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  98.31 
 
 
178 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  90.45 
 
 
178 aa  343  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  88.76 
 
 
178 aa  339  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  88.76 
 
 
178 aa  338  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  88.76 
 
 
178 aa  338  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  89.33 
 
 
178 aa  337  5e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  77.53 
 
 
179 aa  296  8e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  76.97 
 
 
178 aa  296  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  77.53 
 
 
178 aa  293  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  76.27 
 
 
178 aa  284  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  67.76 
 
 
200 aa  264  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  65.17 
 
 
177 aa  249  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  48.85 
 
 
135 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  38.76 
 
 
162 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  34.58 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  31.58 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  30.08 
 
 
172 aa  62  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  34.88 
 
 
104 aa  53.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  31.11 
 
 
109 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  35.87 
 
 
106 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  37.08 
 
 
104 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.21 
 
 
194 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  26.53 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  32.98 
 
 
108 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  32.93 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  31.33 
 
 
108 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  24.49 
 
 
194 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  28.12 
 
 
107 aa  45.1  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  25.85 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.32 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
104 aa  44.7  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  26.02 
 
 
194 aa  44.7  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  36.84 
 
 
104 aa  44.3  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  26.67 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  32.95 
 
 
124 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  31.25 
 
 
104 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  32.22 
 
 
108 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  29.89 
 
 
104 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 
104 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  30.88 
 
 
104 aa  42.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  28.74 
 
 
104 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  26.17 
 
 
220 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  32.31 
 
 
108 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  28.74 
 
 
104 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  32.31 
 
 
108 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  28.74 
 
 
104 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  28.74 
 
 
104 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  28.74 
 
 
104 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  28.74 
 
 
104 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  28.74 
 
 
104 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.88 
 
 
105 aa  42  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  34.33 
 
 
124 aa  42  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  30.49 
 
 
140 aa  41.6  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  35.29 
 
 
104 aa  41.6  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  31.76 
 
 
123 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  29.85 
 
 
95 aa  41.2  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  30.3 
 
 
225 aa  41.2  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  27.4 
 
 
194 aa  41.2  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  36.14 
 
 
108 aa  40.8  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  30.12 
 
 
165 aa  40.8  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  28.75 
 
 
406 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06140  expressed protein  29.41 
 
 
119 aa  40.8  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>