48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0342 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  78.09 
 
 		 178 aa  298  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  77.4 
 
 		 178 aa  295  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  76.27 
 
 		 179 aa  292  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  77.4 
 
 		 178 aa  288  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  76.84 
 
 		 178 aa  288  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  76.84 
 
 		 178 aa  288  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  76.84 
 
 		 178 aa  288  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  76.27 
 
 		 178 aa  286  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  76.27 
 
 		 178 aa  284  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  75.71 
 
 		 178 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  75.71 
 
 		 178 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  74.01 
 
 		 178 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  69.23 
 
 		 200 aa  266  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  69.49 
 
 		 177 aa  264  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  51.15 
 
 		 135 aa  148  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  40.69 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  37.38 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  36.44 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  36.59 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  34.15 
 
 		 109 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  32.94 
 
 		 127 aa  48.5  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  29.63 
 
 		 104 aa  47.8  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  34.09 
 
 		 124 aa  47.8  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  33.75 
 
 		 108 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  32.56 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0820  hypothetical protein  28.04 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.337981  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  35.53 
 
 		 106 aa  44.3  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  30.3 
 
 		 95 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  31.58 
 
 		 106 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2827  hypothetical protein  29.52 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  28.12 
 
 		 107 aa  43.5  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  30.86 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  29.41 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06140  expressed protein  30.88 
 
 		 119 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  31.94 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  32.94 
 
 		 127 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  31.65 
 
 		 104 aa  41.6  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  35.06 
 
 		 105 aa  41.2  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  35.71 
 
 		 109 aa  41.2  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  27.78 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  34.52 
 
 		 109 aa  40.8  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  27.78 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  27.78 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.84 
 
 		 106 aa  40.8  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  27.78 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  27.78 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>