123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0508 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
124 aa  253  7e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  61.98 
 
 
123 aa  148  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  59.2 
 
 
127 aa  148  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  59.17 
 
 
124 aa  141  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  51.54 
 
 
127 aa  98.6  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  43.28 
 
 
200 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  36.59 
 
 
178 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  40.3 
 
 
177 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  35.29 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  27 
 
 
187 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  37.31 
 
 
178 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  37.31 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  37.31 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  29.31 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  36.92 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  32.53 
 
 
179 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  37.31 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  35.37 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  33.8 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  34.29 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  38.67 
 
 
131 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  32.84 
 
 
178 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  36.62 
 
 
146 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  36.67 
 
 
90 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  35.63 
 
 
140 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  34.83 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  37.5 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  31.08 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  35.82 
 
 
178 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  36.92 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  33.33 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  32.97 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  35.82 
 
 
178 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  33.71 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  30.59 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  35.82 
 
 
178 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  34.33 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  30.39 
 
 
406 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  34.21 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.52 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  30.68 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  30.49 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  35 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  33.78 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  30.69 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  28 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  33.78 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  30.88 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  36.76 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  28.42 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  33.67 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  33.67 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  28.74 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  31.87 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  31.87 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  33.67 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  33.67 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  32.35 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  31.08 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  28.38 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  30.68 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1775  thioredoxin  36.11 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  29.69 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  32.81 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  30.68 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  33.85 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1807  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.99 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.132216  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  30.68 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  29.09 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  35.29 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  38.75 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  38.75 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  27.4 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  32.29 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  35.06 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  34.38 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  32.88 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2478  thioredoxin domain-containing protein  40.3 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  30.68 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  36.67 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  35.14 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  32.81 
 
 
146 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  32.88 
 
 
88 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  31.33 
 
 
106 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  30.77 
 
 
104 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  30.68 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.86 
 
 
104 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  30.56 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  34.33 
 
 
178 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  31.51 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  32.26 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  30.99 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  32.93 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  38.1 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  31.25 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  32.22 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  36.84 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>