31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1359 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  249  9.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  57.72 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  54.47 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  51.54 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  52.03 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  34.12 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  33.33 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  32.94 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  32.93 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  29.63 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  32.47 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  32.47 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  34.12 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  30 
 
 		 200 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  32.93 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  32.93 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  29.27 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  32.93 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  36.71 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  28.75 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  30.19 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  31.17 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  31.33 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  35.37 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  38.96 
 
 		 108 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  32.05 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  32.56 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  36.78 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  30.49 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  35.62 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  32.05 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>