50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3430 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  90.45 
 
 		 178 aa  344  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  90.45 
 
 		 178 aa  343  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  90.45 
 
 		 178 aa  344  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  90.45 
 
 		 178 aa  344  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  89.89 
 
 		 178 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  89.89 
 
 		 178 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  89.33 
 
 		 178 aa  340  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  88.76 
 
 		 178 aa  339  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  80.23 
 
 		 178 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  78.09 
 
 		 179 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  78.09 
 
 		 178 aa  296  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  77.4 
 
 		 178 aa  295  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  69.95 
 
 		 200 aa  275  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  68.54 
 
 		 177 aa  262  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  48.85 
 
 		 135 aa  145  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  39.53 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  38.32 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  31.58 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  29.33 
 
 		 104 aa  49.3  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  34.78 
 
 		 106 aa  47.8  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  27.16 
 
 		 109 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  32.84 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.32 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  34.48 
 
 		 104 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  25.17 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  29.27 
 
 		 106 aa  45.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  26.51 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  25.17 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  30.95 
 
 		 108 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  35.53 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  24.83 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  26.02 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  29.47 
 
 		 108 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3573  hypothetical protein  26.53 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140282  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  32.61 
 
 		 104 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  29.17 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  25.23 
 
 		 107 aa  42.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  26.92 
 
 		 104 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  24.56 
 
 		 226 aa  42  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  27.91 
 
 		 127 aa  42  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 		 194 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  25.26 
 
 		 222 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  28.17 
 
 		 123 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  25.26 
 
 		 225 aa  41.2  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  30.99 
 
 		 124 aa  41.2  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  29.27 
 
 		 127 aa  40.8  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  26.47 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.54 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>