22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0443 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  29.14 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  29.71 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  29.71 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  29.71 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  29.71 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  29.14 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  28.81 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  25.99 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  32.71 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  30.08 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  30.08 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  30.08 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  26.97 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  30.08 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  27.27 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  29.5 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  23.53 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  31.71 
 
 		 98 aa  45.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  28.57 
 
 		 124 aa  40.8  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>