42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0409 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  93.82 
 
 		 178 aa  348  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  94.38 
 
 		 178 aa  348  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  94.38 
 
 		 178 aa  348  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  89.89 
 
 		 178 aa  340  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  89.89 
 
 		 178 aa  340  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  89.89 
 
 		 178 aa  340  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  89.33 
 
 		 178 aa  340  5.999999999999999e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  89.33 
 
 		 178 aa  337  5e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  79.78 
 
 		 178 aa  297  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  75.28 
 
 		 178 aa  291  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  74.72 
 
 		 179 aa  288  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  76.27 
 
 		 178 aa  286  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  71.04 
 
 		 200 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  68.54 
 
 		 177 aa  260  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  50.38 
 
 		 135 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  41.27 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  35.51 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  33.33 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  32.33 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  37.31 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  31.76 
 
 		 109 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  30.67 
 
 		 104 aa  48.5  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  35.56 
 
 		 104 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  36.84 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3573  hypothetical protein  25.36 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140282  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  32.43 
 
 		 123 aa  45.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  30.85 
 
 		 108 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  35.53 
 
 		 104 aa  44.7  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  35.21 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  31.71 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  32.94 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  32.93 
 
 		 127 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  31.33 
 
 		 108 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  30.56 
 
 		 146 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 		 194 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  24.19 
 
 		 220 aa  42  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  27.78 
 
 		 107 aa  42  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  33.33 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  25.2 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.94 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  28.4 
 
 		 145 aa  40.8  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>