46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0451 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  279  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  50.38 
 
 		 178 aa  150  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  51.15 
 
 		 178 aa  148  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  49.62 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  49.62 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  48.85 
 
 		 178 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  48.85 
 
 		 178 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  48.85 
 
 		 178 aa  146  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  48.85 
 
 		 178 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  51.91 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  48.85 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  48.82 
 
 		 179 aa  144  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  48.85 
 
 		 178 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  47.69 
 
 		 177 aa  140  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  46.56 
 
 		 178 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  45.04 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  40.62 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  34.58 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  30.7 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  26.77 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  23.53 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  25.81 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  30.88 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  32.58 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  30.56 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  31.31 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  29.63 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  28.7 
 
 		 109 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  24.07 
 
 		 193 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  39.02 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1411  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  19.51 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06140  expressed protein  30.43 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  26.97 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  26.96 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  25.27 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  24.17 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1122  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  23.47 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  24.07 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  25.49 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  24.07 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  28.43 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  25.33 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  24.07 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08630  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.176779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  24.24 
 
 		 192 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>