35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0741 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  100 
 
 		 162 aa  330  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  40.69 
 
 		 178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  40.85 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  41.27 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  41.27 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  37.93 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  41.27 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  41.27 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  39.53 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  38.76 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  38.76 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  38.76 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  38.76 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  40.31 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  40.62 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  35.92 
 
 		 200 aa  98.6  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  37.93 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  37.27 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  29.65 
 
 		 175 aa  84.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  29.32 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  31.19 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  28.16 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  31.76 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  28.89 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  26.88 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  27.64 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  28 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4377  hypothetical protein  37.18 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  31.43 
 
 		 108 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  35.62 
 
 		 406 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  28.93 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  32.29 
 
 		 189 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  32.97 
 
 		 105 aa  40.8  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.13 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>