23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0945 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  358  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  30.99 
 
 		 200 aa  90.9  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  30.9 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  38.32 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  32.68 
 
 		 177 aa  89.4  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  37.38 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  33.94 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  35.51 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  33.64 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  33.64 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  33.64 
 
 		 178 aa  85.1  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  29.65 
 
 		 162 aa  84.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  35.51 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  35.51 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  35.51 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  34.58 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  34.58 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  28.46 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  32.71 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  25.45 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  29.09 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  45.45 
 
 		 406 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  41.6  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>