61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3874 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  98.31 
 
 
178 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  91.01 
 
 
178 aa  347  6e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  90.45 
 
 
178 aa  344  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  89.33 
 
 
178 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  89.33 
 
 
178 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  89.89 
 
 
178 aa  340  5e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  76.97 
 
 
178 aa  298  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  76.97 
 
 
179 aa  297  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  78.09 
 
 
178 aa  296  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  76.84 
 
 
178 aa  288  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  68.31 
 
 
200 aa  268  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  66.29 
 
 
177 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  48.85 
 
 
135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  38.76 
 
 
162 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  35.51 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  31.58 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  30.08 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  32 
 
 
104 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  30 
 
 
109 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  35.87 
 
 
106 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  35.96 
 
 
104 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  34.52 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  35.23 
 
 
124 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  28.89 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  35.82 
 
 
124 aa  45.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  31.71 
 
 
106 aa  45.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.52 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  30.12 
 
 
108 aa  45.1  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  27.08 
 
 
107 aa  44.7  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06140  expressed protein  30.88 
 
 
119 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  25.85 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  32.94 
 
 
123 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  33.33 
 
 
330 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  31.82 
 
 
104 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  36.84 
 
 
104 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  23.81 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  25.5 
 
 
220 aa  42.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.56 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  25.17 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  32.31 
 
 
108 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  25.2 
 
 
194 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  29.89 
 
 
104 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  31.25 
 
 
104 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  32.31 
 
 
108 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  28.74 
 
 
104 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  28.74 
 
 
104 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  28.74 
 
 
104 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  28.74 
 
 
104 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  28.74 
 
 
104 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  28.74 
 
 
104 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  28.74 
 
 
104 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  28.74 
 
 
104 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.51 
 
 
165 aa  41.6  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.43 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  32.94 
 
 
108 aa  41.2  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  32.93 
 
 
127 aa  40.8  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  28.09 
 
 
127 aa  40.8  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  28.77 
 
 
104 aa  40.8  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>