72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4106 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  84.83 
 
 		 178 aa  323  8.000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  78.09 
 
 		 178 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  76.97 
 
 		 178 aa  297  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  76.97 
 
 		 178 aa  297  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  76.97 
 
 		 178 aa  297  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  77.53 
 
 		 178 aa  296  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  75.84 
 
 		 178 aa  295  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  75.28 
 
 		 178 aa  293  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  75.28 
 
 		 178 aa  293  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  76.27 
 
 		 178 aa  292  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  74.72 
 
 		 178 aa  288  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  75.28 
 
 		 178 aa  283  9e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  70.79 
 
 		 177 aa  268  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  65.57 
 
 		 200 aa  255  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  48.82 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  37.93 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  33.94 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  33.93 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  27.41 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  30.49 
 
 		 104 aa  52  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  32.53 
 
 		 124 aa  48.9  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  27.16 
 
 		 109 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  29.03 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  33.75 
 
 		 106 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  33.78 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  30.59 
 
 		 107 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  29.47 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  31.17 
 
 		 104 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  31.17 
 
 		 104 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  30.56 
 
 		 104 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  31.17 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  31.17 
 
 		 104 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  31.17 
 
 		 104 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  31.17 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  31.17 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  31.17 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  32.61 
 
 		 104 aa  45.1  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  29.79 
 
 		 108 aa  45.1  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  27.08 
 
 		 104 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  27.08 
 
 		 104 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  27.08 
 
 		 104 aa  44.7  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.19 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  27.08 
 
 		 104 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  27.08 
 
 		 104 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  27.08 
 
 		 104 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  30.77 
 
 		 104 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  31.11 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  31.71 
 
 		 106 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  34.85 
 
 		 330 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  27.08 
 
 		 104 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  27.08 
 
 		 104 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  34.57 
 
 		 108 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  31.33 
 
 		 105 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.2 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4261  hypothetical protein  41.79 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215632  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  28.42 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  24.49 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  33.66 
 
 		 112 aa  42.4  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  25.17 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  27.37 
 
 		 222 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  24.49 
 
 		 194 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.33 
 
 		 105 aa  42  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06140  expressed protein  27.94 
 
 		 119 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  29.51 
 
 		 194 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  29.17 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  27.43 
 
 		 127 aa  41.6  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2311  thioredoxin family protein  29.87 
 
 		 104 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2156  thioredoxin family protein  29.87 
 
 		 104 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  30.26 
 
 		 106 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  30.95 
 
 		 109 aa  40.8  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>