38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12108 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  100 
 
 		 187 aa  390  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  38.14 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  37.27 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  36.44 
 
 		 178 aa  85.1  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  35.04 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  32.46 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  32.46 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  33.93 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  31.58 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  31.58 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  31.58 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  31.58 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  30.7 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  25.45 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  27.03 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  27 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  32.86 
 
 		 104 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  27.03 
 
 		 127 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  35.14 
 
 		 124 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  37.14 
 
 		 98 aa  45.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  35.14 
 
 		 123 aa  45.1  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  45.1  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  32.56 
 
 		 88 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  26.72 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  31.71 
 
 		 103 aa  43.5  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  37.14 
 
 		 105 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  30.23 
 
 		 326 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  26.51 
 
 		 102 aa  42.4  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.93 
 
 		 104 aa  42  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  35.29 
 
 		 98 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  30 
 
 		 88 aa  42  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  31.58 
 
 		 106 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  34.52 
 
 		 128 aa  41.2  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>