37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2311 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  256  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  64.57 
 
 
124 aa  158  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  59.84 
 
 
123 aa  149  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  59.2 
 
 
124 aa  148  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  52.03 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  32.94 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  27.03 
 
 
187 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  29.37 
 
 
200 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  38.16 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  31.76 
 
 
162 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  30.86 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  32.94 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  29.89 
 
 
107 aa  44.3  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  34.67 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  27.06 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  32.88 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  32.94 
 
 
178 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  32.94 
 
 
178 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  27.91 
 
 
178 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  27.72 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  31.58 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  31.51 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  31.58 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  27.43 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  29.35 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  31.58 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  25.96 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  34.21 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  32.94 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  25.96 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  28.09 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  28.09 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  28.09 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  26.73 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  31.58 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  31.17 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>