48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0517 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  366  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  84.83 
 
 		 179 aa  323  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  80.23 
 
 		 178 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  78.09 
 
 		 178 aa  298  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  76.97 
 
 		 178 aa  298  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  76.97 
 
 		 178 aa  298  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  76.97 
 
 		 178 aa  298  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  76.97 
 
 		 178 aa  297  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  76.97 
 
 		 178 aa  297  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  76.97 
 
 		 178 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  76.4 
 
 		 178 aa  295  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  75.28 
 
 		 178 aa  291  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  73.6 
 
 		 178 aa  279  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  69.49 
 
 		 177 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  66.67 
 
 		 200 aa  258  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  51.91 
 
 		 135 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  40.31 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  30.9 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  35.04 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  31.11 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  30.86 
 
 		 104 aa  51.6  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  48.9  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  33.77 
 
 		 104 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  33.77 
 
 		 104 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  33.77 
 
 		 104 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  33.77 
 
 		 104 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  33.77 
 
 		 104 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 124 aa  48.5  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  33.77 
 
 		 104 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  33.77 
 
 		 104 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  33.77 
 
 		 104 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  29.9 
 
 		 109 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  27.96 
 
 		 104 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2311  thioredoxin family protein  32.47 
 
 		 104 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2156  thioredoxin family protein  32.47 
 
 		 104 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.5 
 
 		 108 aa  44.3  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  32.1 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  29.33 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 106 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48320  hypothetical protein  29.2 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141732  normal  0.0691687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  31.03 
 
 		 124 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  32.94 
 
 		 123 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 		 331 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  21.92 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  27.06 
 
 		 127 aa  42.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  32.14 
 
 		 108 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  30.23 
 
 		 105 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>