112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2175 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  100 
 
 
107 aa  221  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  51.52 
 
 
107 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  52.94 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  54.74 
 
 
106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  50.49 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  53.93 
 
 
90 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  52.53 
 
 
108 aa  110  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  56.04 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  56.04 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  56.04 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  56.04 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  48.11 
 
 
106 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  47.17 
 
 
109 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  55.43 
 
 
112 aa  105  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  56.52 
 
 
109 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  47.27 
 
 
110 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  58.14 
 
 
108 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  47.17 
 
 
117 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  49.49 
 
 
108 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  55.68 
 
 
108 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  47 
 
 
108 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  50.51 
 
 
108 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  50.51 
 
 
108 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  50.51 
 
 
108 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  50.51 
 
 
161 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  52.58 
 
 
108 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  49.49 
 
 
111 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  49.49 
 
 
111 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  52.58 
 
 
108 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  55.68 
 
 
135 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  52.33 
 
 
131 aa  97.1  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  47.52 
 
 
111 aa  96.7  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  51.04 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  47.83 
 
 
112 aa  94.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  34.09 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  35.62 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  29.87 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  33.33 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  28.79 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  32.43 
 
 
768 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  36 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  34.29 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  30.61 
 
 
108 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  30.61 
 
 
108 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  30.59 
 
 
104 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  31.58 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  32.1 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  28.57 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  32.35 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  35.29 
 
 
406 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  26.83 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  32.18 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  27.62 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0459  Thioredoxin domain protein  35.38 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0621095  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  32.05 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  34.33 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  29.89 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  27.18 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  30.26 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  26.32 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  27.27 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  24.71 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  30.88 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  29.11 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  30.88 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  30.88 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  30.88 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  29.41 
 
 
109 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  26.47 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  26.47 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  26.47 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  30.3 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  30.26 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  29.07 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  30 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  28.57 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  34.12 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  25 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  31.58 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  32.14 
 
 
105 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  35.06 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  29.85 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  32.94 
 
 
141 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  28.38 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  29.76 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1772  thioredoxin  26.09 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000134775  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  29.41 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0871  hypothetical protein  28.57 
 
 
225 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  25 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  28.95 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  31.65 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  25.61 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  26.67 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  28.57 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  26.8 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  26.73 
 
 
106 aa  40.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  24.36 
 
 
102 aa  40.4  0.007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  28.57 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  36.23 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>