141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5281 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  100 
 
 		 106 aa  217  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  85.85 
 
 		 106 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  68.57 
 
 		 107 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  61.68 
 
 		 161 aa  143  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  61.68 
 
 		 108 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  61.68 
 
 		 108 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  61.68 
 
 		 108 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  61.32 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  63.64 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  66.67 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  56.6 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  60.61 
 
 		 135 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  60.38 
 
 		 110 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  57.55 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  59.22 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  58.25 
 
 		 108 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  57.58 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  55 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  52.53 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  50.94 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  50.94 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  48.11 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  54.26 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  47.12 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  50.94 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  54.74 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  52.53 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  44.44 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  44.66 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  49.44 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  26.19 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  35.06 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  32 
 
 		 768 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  36.36 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  37.65 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  33.33 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  32.56 
 
 		 406 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  28.92 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  22.35 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  30.23 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  32.2 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  34.78 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  33.8 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  28.05 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  31.75 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  32 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  31.71 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  28.05 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  32 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  28.05 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  28.05 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  26.83 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  30.38 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  27.38 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  29.11 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  36.05 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  30.34 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  31.17 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  31.82 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  31.88 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  25.93 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  33.33 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  33.33 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  31.82 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1775  thioredoxin  44.29 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  39.73 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  26.19 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  31.46 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  31.08 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  27.91 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  34.78 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  27.85 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  34.07 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  33.7 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  28.99 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  30.16 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  29.07 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  33.7 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  31.46 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  33.7 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  30.23 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  30.16 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  32.81 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  34.07 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  34.07 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  29.79 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  32.47 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  32.39 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  21.74 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  24.1 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  32.35 
 
 		 105 aa  42  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  32.39 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  35.29 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  31.46 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>