More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29280 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  94.44 
 
 		 108 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  63.11 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  60.19 
 
 		 107 aa  140  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  61.17 
 
 		 106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  60 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  66.32 
 
 		 108 aa  134  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  58.25 
 
 		 106 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  58.1 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  57.84 
 
 		 111 aa  131  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  57.84 
 
 		 111 aa  131  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  57.84 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  53.77 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  52.78 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  60.78 
 
 		 108 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  60.78 
 
 		 108 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  60.78 
 
 		 108 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  60.19 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  62.11 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  59.8 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  54.81 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  52.88 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  52.48 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  51.43 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  51.49 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  52.87 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  47.47 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  49.53 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  56.63 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  52.58 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  31.82 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  34.09 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  32.18 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  29.27 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1775  thioredoxin  39.19 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  34.88 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  28 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  36.14 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  32.22 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  29.07 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  30.39 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  38.89 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  36.14 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  30 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  29.21 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  35.21 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  34.44 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  34.44 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  31.46 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  36.76 
 
 		 222 aa  52.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  28.57 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  29.47 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  34.44 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  30.53 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  31.65 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  29.55 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  30.68 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  33.33 
 
 		 406 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  32.39 
 
 		 768 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  37.5 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  36.11 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  39.29 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  34.12 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  31.48 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  31.25 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  32.65 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  33.71 
 
 		 259 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  29.21 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  27.18 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  27.62 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  32.18 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  28.85 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  31.87 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  33.78 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  30.34 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  28 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  28.26 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  27.91 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  28.42 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  27.62 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  28.42 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  27.62 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  32.86 
 
 		 338 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  31.82 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  26.67 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  30.23 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  29.89 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  34.41 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  26.67 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  30.99 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  32.97 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  26.67 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  26.04 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>