More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5099 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  283  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  74.83 
 
 
140 aa  209  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  74.83 
 
 
140 aa  209  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  74.83 
 
 
140 aa  209  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  70.63 
 
 
140 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  56.52 
 
 
140 aa  140  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  38.81 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  33.11 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  33.09 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  41.67 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  38.27 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  37.93 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  33.88 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  40.79 
 
 
206 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  39.19 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  30.1 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  36.78 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  32.94 
 
 
104 aa  60.8  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  35.64 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  34.18 
 
 
104 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  32.95 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  29.55 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  34.57 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  38.37 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  32.63 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  30.43 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  36.36 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  29.93 
 
 
175 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  37.66 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  31.87 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  30.85 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  32.29 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  31.25 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  35.87 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  34.18 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  35.87 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  35.87 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  34.44 
 
 
98 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  31.52 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  32.99 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  35.8 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  32.29 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  35.64 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  31.37 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  31.52 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.32 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  30 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  32.53 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  29.81 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  36.27 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  33.75 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  33.75 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  36.25 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  33.7 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  34.67 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  32.5 
 
 
102 aa  55.5  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  35.48 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  32.61 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  32.04 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  36.36 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  37.66 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  35.23 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  36.56 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  31.87 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.52 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  28 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  28 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  37.04 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  30.49 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  32.5 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  32.89 
 
 
133 aa  53.5  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  30.43 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  37.93 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  32.94 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  29.31 
 
 
278 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  36.73 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  24.71 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  38.1 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  32.38 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf030  thioredoxin family member  33.33 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  38.46 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  27.08 
 
 
278 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  31.11 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  35.62 
 
 
338 aa  52.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  32.88 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  29.7 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  29.29 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  33.01 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  29.9 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  34.18 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.56 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  28.45 
 
 
278 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5974  thioredoxin domain protein  34.92 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.897668  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  32.94 
 
 
89 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  30.23 
 
 
98 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  28.26 
 
 
98 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  30 
 
 
91 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  31.52 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>