155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4352 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 112 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  72.9 
 
 		 175 aa  150  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  75.24 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  74.04 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  66.29 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  67.07 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  59.8 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  49.48 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  56.47 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  55.7 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  46.15 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  59.55 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  50 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  43.53 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  41.56 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  41.56 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  41.56 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  38.27 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  38.27 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  38.82 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  41.25 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  29.73 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  32.94 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  26.97 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  32.93 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  33.66 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  37.04 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  33.33 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  29.46 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  28.71 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  40.85 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  30 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  32.89 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  40 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  31.46 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  29.63 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  27.78 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  31.46 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  31.46 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  34.78 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  34.67 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  35.71 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  34.83 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  31.51 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  32.89 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  24.72 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  22.97 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  27.78 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  27.78 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  30.67 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  31.08 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  33.96 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  33.96 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  29.41 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  39.66 
 
 		 271 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  30.53 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  31.03 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  26.32 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  28.12 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  30.38 
 
 		 112 aa  42.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  33.33 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  29.85 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  29.63 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  34.57 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  25.33 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5974  thioredoxin domain protein  25.84 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.897668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  30.56 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  31.68 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  26.19 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  29.67 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  21.79 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  35.71 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  26.67 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  33.9 
 
 		 461 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  25.32 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  31.51 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  31.33 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  33.77 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  29.63 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  31.52 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.51 
 
 		 816 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  33.9 
 
 		 461 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  19.15 
 
 		 104 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  27.38 
 
 		 108 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  30.86 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  31.08 
 
 		 105 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  26 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  29.33 
 
 		 98 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  31.58 
 
 		 109 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  27.91 
 
 		 107 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  27.4 
 
 		 102 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  26.58 
 
 		 104 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  25.93 
 
 		 106 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  31.43 
 
 		 149 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  27.38 
 
 		 108 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  28.4 
 
 		 456 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>