119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0458 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  342  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  61.69 
 
 		 143 aa  167  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  58.17 
 
 		 149 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  72.9 
 
 		 112 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  69.66 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  46.34 
 
 		 146 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  56.45 
 
 		 206 aa  114  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  54.55 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  43.1 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  48.57 
 
 		 141 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  42.42 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  37.33 
 
 		 145 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  46.83 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  36.96 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  46.15 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  37.66 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  37.66 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  37.66 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  29.93 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  35.8 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  39.51 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  35.16 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  37.04 
 
 		 98 aa  52  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  28.28 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  31.82 
 
 		 104 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  26.09 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  32.65 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  25.88 
 
 		 102 aa  48.5  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  29.17 
 
 		 105 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  27.27 
 
 		 109 aa  48.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  34.12 
 
 		 124 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  29.7 
 
 		 106 aa  47.8  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  27.5 
 
 		 117 aa  47.8  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  35.96 
 
 		 101 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  38.16 
 
 		 107 aa  47.4  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  34.12 
 
 		 124 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  34.12 
 
 		 124 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  34.12 
 
 		 124 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  24 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  31.46 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  29.13 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  37.04 
 
 		 108 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  33.04 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  26.39 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  28 
 
 		 102 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  31.08 
 
 		 117 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  26.97 
 
 		 98 aa  45.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  22.07 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  25.93 
 
 		 126 aa  45.1  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  27.47 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  39.66 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  32.65 
 
 		 286 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  27 
 
 		 104 aa  44.3  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  29.21 
 
 		 125 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  24.73 
 
 		 102 aa  44.3  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2555  glutaredoxin  34.57 
 
 		 104 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  29.41 
 
 		 105 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  29.55 
 
 		 103 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  29.55 
 
 		 103 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  29.21 
 
 		 105 aa  44.3  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  29.89 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  30.34 
 
 		 104 aa  43.9  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  34.38 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  30.38 
 
 		 102 aa  44.3  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  29.17 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  28.21 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  27.59 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  28.09 
 
 		 105 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  32.22 
 
 		 106 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  28.4 
 
 		 88 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  31.46 
 
 		 122 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  31.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  31.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  34.57 
 
 		 109 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  25.64 
 
 		 104 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  31.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  31.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  31.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  31.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  31.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  28.21 
 
 		 106 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  31.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  32.05 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  33.33 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  31.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  30.34 
 
 		 104 aa  42  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  23.48 
 
 		 140 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  32.43 
 
 		 109 aa  42.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  30.34 
 
 		 104 aa  42  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  22.12 
 
 		 104 aa  42  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  28.89 
 
 		 108 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  30.93 
 
 		 108 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  30.21 
 
 		 110 aa  42  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  29.03 
 
 		 109 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  24.58 
 
 		 170 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  32.53 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  25.29 
 
 		 106 aa  42  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  31.43 
 
 		 105 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>