29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4375 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  276  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  48.59 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  43.94 
 
 
149 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  49.06 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  39.47 
 
 
175 aa  94.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  43.41 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  50 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  47.87 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  50.6 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  46.32 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  46.51 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  39.25 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  33.08 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  33.08 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  33.08 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  32.35 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  33.33 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  35.71 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  40.24 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  32.41 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  24.14 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  24.14 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  35.87 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  29.89 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2862  hypothetical protein  22.64 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.816123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2547  hypothetical protein  22.64 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  30.12 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  41.67 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  28.57 
 
 
107 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>