More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4614 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  74.83 
 
 		 143 aa  209  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  71.43 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  67.65 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  39.39 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  35.25 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  35.11 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  41.56 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  31.03 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  31.25 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  43.06 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  36.25 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  40.26 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  36.9 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  40 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  38.1 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  38.04 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  37.66 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  38.04 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  38.04 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  38.64 
 
 		 206 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  34.67 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  35.87 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  32.14 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  37.84 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  33.33 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  36.19 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.68 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  37.78 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  34.83 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  37.8 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  31.52 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  36.26 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  35.44 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  38 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  35.44 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  31.82 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  35.44 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  32.71 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  35.62 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  34.15 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  31.82 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  35.06 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  34.44 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  36.36 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  38.67 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  29.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  30.43 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  34.57 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  28.57 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  32.29 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  32.61 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  32.5 
 
 		 106 aa  57  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  28.57 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  32.5 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  36.56 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  34.83 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  36.71 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  36.84 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  34.94 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  36 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  30.95 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  30.34 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  30.34 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  32.95 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  35.16 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  35.62 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  36.49 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  41.38 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  31.87 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  36.62 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  30.95 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  33.66 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  38.46 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  37.04 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  35.37 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  34.15 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  31.94 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  33.66 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  33.85 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  34.34 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  34.48 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  34.48 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  41.67 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  34.48 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  30 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  28.75 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  38.71 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  36.78 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  40.51 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  38.46 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>