70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6171 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 206 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  73.33 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  66.33 
 
 		 143 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  56.45 
 
 		 175 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  67.44 
 
 		 170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  62.2 
 
 		 149 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  59.8 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  57.83 
 
 		 155 aa  88.2  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  62.5 
 
 		 120 aa  85.5  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  44.83 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  60 
 
 		 130 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  50.54 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  48.68 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  49.32 
 
 		 141 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  40.79 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  38.64 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  38.64 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  38.64 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  38.64 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  37.61 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  47.06 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  40.86 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  40 
 
 		 106 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  28.09 
 
 		 98 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  30.39 
 
 		 140 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  35.63 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  23.68 
 
 		 104 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  32.43 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  30.11 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  30.11 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  34.78 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  30.11 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  30.11 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  30.11 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  30.11 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  30.11 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  30.11 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  30.11 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  28.36 
 
 		 88 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  32.47 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  37.5 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  30.86 
 
 		 88 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  32.95 
 
 		 107 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  32.5 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4209  thioredoxin  33.04 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  31.33 
 
 		 144 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  26.03 
 
 		 120 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  31.75 
 
 		 108 aa  42.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3451  thioredoxin  35.56 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.560369  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  30.11 
 
 		 139 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  30.11 
 
 		 139 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  24.82 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  30.11 
 
 		 139 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  30.11 
 
 		 139 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  30.11 
 
 		 139 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  35.06 
 
 		 144 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  31.51 
 
 		 105 aa  42.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.36 
 
 		 816 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  40.35 
 
 		 107 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  31.93 
 
 		 145 aa  42  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  31.75 
 
 		 108 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  26.03 
 
 		 120 aa  42  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  34.72 
 
 		 120 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  31.75 
 
 		 120 aa  41.6  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  27.4 
 
 		 109 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  30.59 
 
 		 105 aa  41.6  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  30.59 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  30.59 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  30.59 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>