67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6826 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  258  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  45.77 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  39.51 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  34.06 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  35.56 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  39.6 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  35.66 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  35.38 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  39.77 
 
 		 206 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  37.04 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2002  thiol/disulfide interchange protein  33 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  34.57 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  32.14 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  35.96 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  26.62 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  30.86 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  30.86 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  30.86 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  29.76 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  35.71 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  35.8 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  32.1 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  35.96 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  32.65 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  29.73 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  34.29 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  34.44 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  42.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4649  rhodanese domain-containing protein  27.85 
 
 		 238 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.16 
 
 		 583 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.16 
 
 		 583 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  28.97 
 
 		 614 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  30 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  42.11 
 
 		 130 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  29.27 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  28.09 
 
 		 98 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  25.32 
 
 		 102 aa  42  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  30.77 
 
 		 421 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  28.33 
 
 		 302 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  30.49 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0908  redox-active disulfide protein 1  30 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  26.26 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  37.5 
 
 		 287 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2781  thioredoxin  28.05 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.528601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  31.15 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  30.23 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  25.37 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  31.65 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  25.37 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5132  putative thioredoxin  25.53 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000123697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  25.37 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  25.37 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1036  redox-active disulfide protein 1  30 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  23.36 
 
 		 324 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  25.37 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  30.23 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  28.77 
 
 		 458 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  25.37 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  30.23 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  25.37 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  24.27 
 
 		 320 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  26.92 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  36.71 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  25.37 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 104 aa  40  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  30.3 
 
 		 106 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  29.31 
 
 		 334 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>