200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4643 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  100 
 
 		 120 aa  233  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  54.55 
 
 		 175 aa  96.7  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  56.47 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  55.84 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  56.47 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  54.32 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  61.11 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  62.5 
 
 		 206 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  47.47 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  43.02 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  47.37 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  32.94 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  47.95 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  35.64 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  44.74 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  37.8 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  37.8 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  37.8 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  43.02 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  36.36 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  35.9 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  38.37 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  35.9 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  35.9 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  32.93 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  31.71 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  35.35 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  42.68 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  31.33 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  37.21 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  34.02 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  37.04 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  32.93 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  26.25 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  29.47 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  34.88 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  25.88 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  37.66 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  27.47 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  42.03 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  39.56 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  36.62 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  34.12 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  32.94 
 
 		 406 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7608  predicted protein  31.25 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  39.02 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  34.12 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  32.14 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  31.76 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  25.58 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  29.87 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  30.59 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  27.62 
 
 		 460 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  29.41 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  31.33 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  32.53 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  32.05 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  32.53 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  32.53 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  27.06 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  32 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  25.84 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  32.58 
 
 		 326 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  30.12 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  29.27 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  32.58 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  30.59 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  34.15 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  28.05 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  31.82 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  22.73 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  25.27 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  34.62 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  26.88 
 
 		 269 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  33.72 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  35.96 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  29.41 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  30.59 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2555  glutaredoxin  30.38 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  30.86 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  30.11 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  28.74 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  31.03 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  27.88 
 
 		 461 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  30.23 
 
 		 109 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  29.41 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  29.73 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4209  thioredoxin  34.41 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  29.17 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  27.88 
 
 		 461 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  25.88 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  28.89 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  26.19 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>