113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2555 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2555  glutaredoxin  100 
 
 		 104 aa  216  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0464  thioredoxin, putative  54.95 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.973322  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1202  thioredoxin, putative  48.81 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267442  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  33.33 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  28.71 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  31.88 
 
 		 286 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  27.45 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  34.78 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  34.78 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  29.89 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  34.52 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  24.51 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0760  ribosomal protein L12E/L44/L45/RPP1/RPP2-like protein  26.37 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.511664 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  34.43 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  26.67 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  27.45 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  23.76 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  34.62 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07567  hydroperoxide and superoxide-radical responsive glutathione-dependent oxidoreductase (Eurofung)  28.28 
 
 		 275 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.746222  normal  0.140818 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  34.94 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  24.39 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  32.47 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  33.85 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  26.97 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  27.91 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  30.93 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  37.68 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  32.47 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.4 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02900  thioredoxin  32.5 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  22.78 
 
 		 289 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0227  thioredoxin-related  27.27 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  32.47 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  28.77 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  27.03 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  30.38 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2293  Thioredoxin domain  30.12 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.126467 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  26.03 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  29.11 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  34.57 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  25.24 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.78 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  26.88 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0348  hypothetical protein  29.41 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3446  thioredoxin family protein, selenocysteine-containing  30.67 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238909  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  30.49 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  30.26 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  25.61 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  26 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  26.92 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  28.71 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  27.91 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3383  Thioredoxin domain protein  32.91 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.346342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  26.83 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  26.83 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  24.05 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  27.54 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  26.83 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0850  Thioredoxin domain protein  26.03 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190826  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  32.2 
 
 		 816 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  28.99 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  31.65 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  28.75 
 
 		 125 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  30.49 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0678  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182465  unclonable  0.0000000142494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  28.71 
 
 		 146 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  29.17 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  30.43 
 
 		 107 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  27.54 
 
 		 289 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  24.75 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  27.54 
 
 		 289 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  27.54 
 
 		 289 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  26.88 
 
 		 123 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  28.28 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  32.1 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  30.95 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  27.45 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  27.45 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  27.45 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  30.3 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  30 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  26.58 
 
 		 257 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  26.53 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  33.33 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  27.4 
 
 		 246 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  24.51 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  26.53 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf029  thioredoxin family member  26.67 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  26.19 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  29.73 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  26.74 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  28.17 
 
 		 299 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  26.74 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  26.03 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  27.63 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  29.73 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  24.68 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  26.26 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>