95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02900 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02900  thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  220  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0540  thioredoxin  66.67 
 
 		 108 aa  159  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0477  thioredoxin domain-containing protein  66.67 
 
 		 108 aa  159  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2293  Thioredoxin domain  61.54 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.126467 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  34.94 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  37.21 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  33.33 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  38.55 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  30.1 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  33.64 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  39.56 
 
 		 290 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  34.62 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  34.41 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  36.67 
 
 		 289 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  36.9 
 
 		 289 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  30.56 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  32.26 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  29.36 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  36.9 
 
 		 289 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  35.24 
 
 		 406 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  36.71 
 
 		 575 aa  45.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  32.56 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  35.63 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2555  glutaredoxin  32.5 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  33.68 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  28.85 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1202  thioredoxin, putative  32.63 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267442  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  34.62 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  34.48 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  37.36 
 
 		 290 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  37.36 
 
 		 290 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  31.48 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.35 
 
 		 731 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  33.33 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  37.36 
 
 		 290 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  37.36 
 
 		 290 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  34.91 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  30.56 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  30.56 
 
 		 140 aa  43.5  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0020  disulfide bond formation protein A  22.83 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000839687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  31.76 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  33.33 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  33.33 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  33.67 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  29.17 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  29.63 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  29.07 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  32.53 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  27.59 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  29.59 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  36.84 
 
 		 146 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  25.23 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 		 570 aa  41.6  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  30.59 
 
 		 106 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  32.61 
 
 		 119 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  27.84 
 
 		 123 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  28.57 
 
 		 125 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  30.85 
 
 		 145 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  36.84 
 
 		 146 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  28.87 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  37.5 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  34.48 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  28.05 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  37.5 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  29.41 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  35.23 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  32.53 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  32.53 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  28.92 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  32.95 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  32.53 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  32.53 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  30.77 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  33.33 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  33.72 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  33.67 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  32.97 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  31.63 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  29.63 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  32.65 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  35 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  31.96 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  28.7 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  34.72 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  37.97 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  34.72 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  29.41 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  32.95 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.43 
 
 		 690 aa  40  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  34.09 
 
 		 144 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  32.53 
 
 		 109 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>