More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0540 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0477  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 108 aa  223  8e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0540  thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  223  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02900  thioredoxin  66.67 
 
 		 108 aa  159  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2293  Thioredoxin domain  55.56 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.126467 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  36.05 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  34.29 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  35.16 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  34.48 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  30.19 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  34.31 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  31.19 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  33.02 
 
 		 421 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  36.84 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  30.56 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  28.89 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  30.61 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  29.59 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  29 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  31.31 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  28.89 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  29.91 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  34.88 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  34.88 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  32.67 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  32.53 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  30.11 
 
 		 107 aa  47.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  31.25 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  35.56 
 
 		 290 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  34.12 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  34.62 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  31.18 
 
 		 147 aa  47.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  32.05 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  28.3 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  29.9 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  32.14 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  32.14 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  30.56 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  30 
 
 		 259 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  30.49 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  32.08 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  28.3 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  31.91 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  29.29 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0020  disulfide bond formation protein A  23.91 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000839687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  31 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  31.18 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  31.87 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  30.69 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  31.96 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  28.24 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  27.36 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  32.61 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  29.03 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  29.03 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  27.52 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  32.26 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  35.14 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  34.62 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  32.26 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  29.41 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  28.97 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  26.85 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  34.72 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  29.81 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  29.63 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  27.84 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  34.52 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  31.37 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  30.11 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  32.61 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  32.61 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  29.41 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  27.36 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  29.35 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  29.35 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  31.76 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  31.18 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  30.86 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  33.33 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  30.1 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  33.67 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  30.48 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  31.65 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  31.87 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  29.52 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  33.67 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>