92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0900 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  290  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  58.17 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  62.59 
 
 		 143 aa  157  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  74.04 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  63.27 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  60.71 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  62.2 
 
 		 206 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  48.62 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  41.43 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  55.84 
 
 		 120 aa  90.5  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  54.67 
 
 		 175 aa  87.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  40.62 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  41.67 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  50.48 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  35.11 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  35.11 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  35.11 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  33.09 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  40.74 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  41.25 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  33.82 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  35.78 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  32.65 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  32.17 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  33.33 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  27.37 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  33.33 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  33.33 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  35.8 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  28.72 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  30.69 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  28.85 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  31.76 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  29.76 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  25.51 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  31.76 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  27.18 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  25.56 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  23.53 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  27.91 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  30.14 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  27.63 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  28.38 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  21.55 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  23.6 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  39.13 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  37.93 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  25.53 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  35.53 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  29.73 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  29.21 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  29.58 
 
 		 122 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  29.03 
 
 		 117 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  23.91 
 
 		 104 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  31.91 
 
 		 106 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  25 
 
 		 123 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  26.14 
 
 		 140 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  26.14 
 
 		 178 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2555  glutaredoxin  32.1 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  25 
 
 		 123 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  21.84 
 
 		 102 aa  42  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  32.35 
 
 		 110 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  27.06 
 
 		 98 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  31.52 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  24.1 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  31.52 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  25.81 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  31.52 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  24 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  29.21 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1202  thioredoxin, putative  29.59 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267442  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  26.58 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  33.9 
 
 		 460 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  31.82 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  27.78 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  27.37 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  28.07 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  32.26 
 
 		 461 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  32.26 
 
 		 461 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  23.4 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  24.76 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  26.09 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  24.47 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  28.24 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  24.32 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  24.24 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  21.78 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  34.48 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4125  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.63 
 
 		 399 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  29.58 
 
 		 123 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05590  thioredoxin, putative  31.25 
 
 		 242 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.32051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>