More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_31720 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  100 
 
 		 133 aa  275  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  36.52 
 
 		 165 aa  83.6  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  41.67 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  43.9 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  45.07 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  35.78 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  39.39 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  41.43 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  36.46 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  36.46 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  39 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  42.67 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  38.46 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  32.04 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  33.66 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  38.57 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  33.66 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  32.63 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  46.38 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  38.75 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  38.27 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  34.04 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  31.58 
 
 		 104 aa  67  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  33.33 
 
 		 330 aa  67  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  36.17 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  46.38 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  39.51 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  38.75 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  35.42 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  34.83 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  36.36 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  40 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  31.62 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  34.95 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  30.93 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  40 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  32.99 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  44 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  31.96 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  35.79 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  36.26 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  34.41 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  32.67 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  31.07 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  32.38 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  36.49 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  32.38 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  34.69 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  31.07 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  32.38 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.98 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  31.07 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  40 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  34 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  35.14 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  37.04 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  39.45 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  33.04 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  36.14 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  40.48 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  34.44 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  44.78 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  35.11 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  31.43 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  31.73 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  37.21 
 
 		 246 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  36.14 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  30.56 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  35.87 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  35.48 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  32.98 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  40.85 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  38.27 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  33.65 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  40.85 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  36.17 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2121  Thioredoxin domain protein  34.07 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.427267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  37.18 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  30.93 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  30.93 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  38.57 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  33.01 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  33.63 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  50.75 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  28.18 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  40.51 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  40.3 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  32.26 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  40 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  43.48 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  35.14 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  35.14 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  35.11 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  30.69 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  32.97 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>