More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56521 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  100 
 
 
169 aa  350  4e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  37 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  34.62 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  37.36 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.43 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  32.04 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  34.74 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01200  thioredoxin (trx), putative  40.58 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954839  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  34.52 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  35.96 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  30.19 
 
 
338 aa  67.8  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  31.25 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  35.05 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  31.18 
 
 
101 aa  67  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  36.27 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  31.73 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  33.33 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  28.57 
 
 
119 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  33 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  32.94 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  33.71 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  36.05 
 
 
105 aa  62  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  31.07 
 
 
105 aa  61.6  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  27.62 
 
 
104 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  31.82 
 
 
272 aa  61.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1343  thioredoxin  40 
 
 
105 aa  61.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  36.05 
 
 
106 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  32.14 
 
 
145 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  35.71 
 
 
143 aa  60.8  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  25 
 
 
117 aa  60.8  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  38.82 
 
 
108 aa  60.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  36.96 
 
 
286 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  33.68 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  31.33 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06230  thioredoxin  31.87 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  32.38 
 
 
110 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  31.73 
 
 
124 aa  60.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  36.47 
 
 
105 aa  60.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  32.53 
 
 
102 aa  60.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  32.58 
 
 
108 aa  59.7  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  35.71 
 
 
106 aa  59.7  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  30.69 
 
 
113 aa  60.1  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  35.42 
 
 
119 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  28.46 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  29.9 
 
 
106 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  26.73 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4265  Thioredoxin domain protein  38.89 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  29.9 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  33.77 
 
 
103 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  28.72 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  35.42 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  32.97 
 
 
111 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  35.16 
 
 
108 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  26.21 
 
 
103 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  29.9 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  29.9 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  36.11 
 
 
89 aa  59.3  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  29.9 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  26.21 
 
 
103 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  34.21 
 
 
104 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  32.14 
 
 
130 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  36.14 
 
 
148 aa  58.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  25.56 
 
 
106 aa  58.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  34.44 
 
 
280 aa  58.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  29.9 
 
 
106 aa  58.5  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  28.18 
 
 
142 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  35.29 
 
 
108 aa  58.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  30.61 
 
 
110 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4260  thioredoxin  38.03 
 
 
109 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  35.29 
 
 
107 aa  58.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  29.9 
 
 
106 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0770  Thioredoxin domain protein  29.36 
 
 
103 aa  58.2  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  34.62 
 
 
120 aa  58.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  35.71 
 
 
104 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  35.71 
 
 
104 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  39.34 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  35.44 
 
 
768 aa  58.2  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  29.79 
 
 
109 aa  57.8  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  29.67 
 
 
104 aa  57.8  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  30 
 
 
141 aa  57.8  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  33.33 
 
 
126 aa  57.8  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  27.08 
 
 
139 aa  57.4  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  24.51 
 
 
104 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  32 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  34.52 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  28.74 
 
 
103 aa  57  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  26.67 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  24.51 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  35.05 
 
 
110 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  35.8 
 
 
105 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  25.42 
 
 
120 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  35 
 
 
107 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  24.51 
 
 
104 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  33.33 
 
 
105 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  33.72 
 
 
109 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  29.03 
 
 
223 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  28.85 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  33.33 
 
 
105 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  23.53 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  32.58 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>