More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06230 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06230  thioredoxin  100 
 
 		 104 aa  214  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0770  Thioredoxin domain protein  61.17 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  64.36 
 
 		 102 aa  140  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4265  Thioredoxin domain protein  60.4 
 
 		 103 aa  133  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  38.27 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  31.87 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  37.97 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.32 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01200  thioredoxin (trx), putative  32.53 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954839  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  27.72 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  39.02 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  34.94 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  28.43 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  32.61 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  26.47 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  32.1 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  31.37 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  31.25 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  34.25 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  28.26 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  30 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  33.78 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46280  thioredoxin f  37.5 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767302  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  32.5 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  37.7 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  33.82 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  33.68 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  38.81 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  31.65 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  38.6 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  33.67 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  37.14 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  28.26 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  27.66 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  30.34 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  34.21 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  37.1 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  38.46 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  29.29 
 
 		 193 aa  50.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  31.46 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  30 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  33.75 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2121  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.427267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  32.56 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  35.21 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  27.16 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  33.33 
 
 		 268 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  32.43 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  30.1 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  30.38 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  32.26 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  30.38 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  32.91 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  32.91 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  33.78 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  28.21 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  34.29 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  28.28 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  40.3 
 
 		 700 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  29.49 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  26.09 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  34.29 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46652  predicted protein  28.12 
 
 		 551 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  31.17 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  29 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  30.95 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  30.95 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  28.57 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  29.07 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  32.1 
 
 		 406 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  33.78 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  31.43 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  31.76 
 
 		 411 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  31.17 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  34.78 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  29.79 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  27.85 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  28.57 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  30.43 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  31.67 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  31.65 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  33.78 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  29.49 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  32.94 
 
 		 272 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  32.41 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  26.32 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  34.78 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  30.59 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  32.58 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  25.74 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  29.13 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  29.9 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  38.71 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  34.92 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  33.68 
 
 		 287 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  30.77 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  27.37 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  29.49 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>