More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46652 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46652  predicted protein  100 
 
 		 551 aa  1140    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00250  DNA-binding protein  34.31 
 
 		 325 aa  104  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0779011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  37.33 
 
 		 106 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  32.26 
 
 		 113 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  36.17 
 
 		 127 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0788  thioredoxin  35.63 
 
 		 110 aa  56.2  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  33.33 
 
 		 119 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.87 
 
 		 165 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  32.29 
 
 		 105 aa  55.1  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  34.74 
 
 		 287 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  33.04 
 
 		 406 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  29.47 
 
 		 107 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  30.63 
 
 		 117 aa  54.7  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  27.96 
 
 		 104 aa  54.3  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  35.53 
 
 		 107 aa  54.7  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  54.7  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  39.13 
 
 		 106 aa  54.3  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  31.18 
 
 		 109 aa  53.9  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  31.18 
 
 		 119 aa  53.9  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  32.29 
 
 		 136 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  31.25 
 
 		 290 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  29.6 
 
 		 290 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  32.58 
 
 		 108 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  28.85 
 
 		 108 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  38.46 
 
 		 107 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  31.25 
 
 		 290 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  29.35 
 
 		 108 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  34.15 
 
 		 142 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  32.29 
 
 		 109 aa  53.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  31.25 
 
 		 290 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  38.67 
 
 		 146 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  31.4 
 
 		 107 aa  52.8  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  31.15 
 
 		 290 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  35.9 
 
 		 145 aa  52  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  31.91 
 
 		 103 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  33.68 
 
 		 108 aa  51.6  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  31.33 
 
 		 109 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  32.94 
 
 		 109 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  31.25 
 
 		 289 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  32.98 
 
 		 98 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  32.94 
 
 		 109 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.96 
 
 		 289 aa  51.2  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  34.58 
 
 		 105 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  31.33 
 
 		 109 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.29 
 
 		 290 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  31.82 
 
 		 106 aa  51.2  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  36.47 
 
 		 113 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  31.25 
 
 		 289 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  36.05 
 
 		 146 aa  51.2  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  35.63 
 
 		 107 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  29.03 
 
 		 107 aa  50.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  28.41 
 
 		 119 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  32.14 
 
 		 105 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  35.71 
 
 		 120 aa  50.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  32.63 
 
 		 107 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  27.84 
 
 		 146 aa  50.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  32.53 
 
 		 107 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  27 
 
 		 259 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  25 
 
 		 105 aa  50.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  32.93 
 
 		 110 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  35.14 
 
 		 106 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  28.87 
 
 		 108 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  30.21 
 
 		 290 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  31.87 
 
 		 102 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  28.87 
 
 		 108 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  32.94 
 
 		 109 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  40.85 
 
 		 141 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  35.14 
 
 		 141 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  28.87 
 
 		 108 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  28.87 
 
 		 108 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  28.87 
 
 		 108 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  28.87 
 
 		 108 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  28.87 
 
 		 108 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  28.87 
 
 		 108 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06230  thioredoxin  28.12 
 
 		 104 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  29.03 
 
 		 107 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  33.77 
 
 		 107 aa  48.9  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94593  predicted protein  34.15 
 
 		 377 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  33.78 
 
 		 106 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  29.03 
 
 		 107 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2143  Thioredoxin domain protein  31.48 
 
 		 108 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  29.03 
 
 		 107 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  31.71 
 
 		 108 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  34.52 
 
 		 108 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  33.33 
 
 		 160 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  30.93 
 
 		 120 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  30.19 
 
 		 110 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  35.71 
 
 		 108 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  35.14 
 
 		 159 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  33.33 
 
 		 145 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  28.09 
 
 		 149 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  30.93 
 
 		 108 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  38.36 
 
 		 105 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  30.34 
 
 		 105 aa  48.9  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  28.89 
 
 		 115 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>