More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46280 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46280  thioredoxin f  100 
 
 		 174 aa  357  3e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767302  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  40.2 
 
 		 105 aa  87.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  41.84 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  42.72 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26335  predicted protein  42.55 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  40.74 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  37.84 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  35.94 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  39.62 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  39.81 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  34.96 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  40.23 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  39.25 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  35.92 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  40.7 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  35.19 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  37.5 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  38.89 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  34.95 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  34.95 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  34.95 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  34.95 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  40 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  37.5 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  35.24 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  36 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  41.75 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  40.54 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  33.9 
 
 		 259 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  33.01 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  44.59 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  44.59 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  44.59 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  44.59 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  44.59 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  44.59 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  44.59 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  44.59 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  48.65 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  44.59 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.95 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  35.29 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  37.37 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  40 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  36.67 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  40.54 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  40.54 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  42.55 
 
 		 106 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  35.58 
 
 		 109 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  48.53 
 
 		 106 aa  67  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  35.71 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  30.23 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  41.98 
 
 		 129 aa  67.4  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  40.51 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  36.84 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  45.95 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  41.89 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  31.71 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  40.54 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  40.66 
 
 		 700 aa  66.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  40.22 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  42.47 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  43.24 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  33.01 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  43.24 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  43.24 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  43.24 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  40.78 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  43.24 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0788  thioredoxin  31.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  39.19 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  42.05 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  39.13 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  45.95 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  42.72 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  38.89 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  35.24 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  45.45 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  43.42 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  41.89 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  33 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  32.41 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  36.59 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  39.74 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  43.24 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  42.31 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  34.86 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  41.56 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  44.59 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  35.29 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  35.05 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  36 
 
 		 290 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  30.23 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  40.51 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  39.74 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  39.08 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  35.71 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  42.31 
 
 		 106 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  39.08 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>