More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1304 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  72.82 
 
 		 103 aa  167  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  72.82 
 
 		 103 aa  167  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  49 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  49 
 
 		 104 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  49 
 
 		 104 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  48 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  48 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  48 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  48 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  48 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  48 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  48 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  41 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  38.38 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40.78 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  46.43 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  37.76 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  42.27 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  43.21 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  38.82 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0847  thioredoxin domain-containing protein  32.04 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00144466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0830  thioredoxin domain-containing protein  32.04 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0432193  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  36.45 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  29.7 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  27.72 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  26.92 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  26.92 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  32.26 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  26.92 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  26.92 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  25.96 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  25.96 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  34.58 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  25 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  25 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  36.17 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  28.72 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  33.96 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  33.78 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  26.42 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1807  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.73 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.132216  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  30.61 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  33.33 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  28.57 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  28.57 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  30 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  32.71 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  33.64 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  28.74 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.96 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  32.95 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  33.64 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  27.88 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2156  thioredoxin family protein  24.04 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  31.78 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2311  thioredoxin family protein  24.04 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  31.76 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  29 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  30.39 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  30.69 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  31.78 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  30.93 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  31.78 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  26.03 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  33.33 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  32 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  31.78 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  38.16 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  34.29 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  31.76 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  33.02 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  33.02 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  30.49 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  33.02 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  30.77 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  29.76 
 
 		 406 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  33.02 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  26.8 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  36.71 
 
 		 193 aa  52.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  28.16 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  28.97 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  33.02 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  25.49 
 
 		 277 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  31.91 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1625  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.94 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000722607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  30.67 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  28.97 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  29 
 
 		 238 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  28.97 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  29.91 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  29.07 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0788  thioredoxin  32.56 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  30 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  28.09 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  33.78 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  31.03 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>