More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1721 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  100 
 
 
100 aa  207  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  43.56 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  41.18 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  44.55 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  44.55 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  42.11 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  46.53 
 
 
104 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  40.66 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  40.86 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  37.11 
 
 
102 aa  88.2  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  38.14 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  39.81 
 
 
105 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  38.95 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  41.24 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  40.82 
 
 
106 aa  87  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  41.94 
 
 
105 aa  87  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  41.3 
 
 
109 aa  87  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  36.89 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1772  thioredoxin  43.43 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000134775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  36.73 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  40.2 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  36.84 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  40.21 
 
 
105 aa  84.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  35.79 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  37.25 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  36.84 
 
 
109 aa  84.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  39 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  84.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  44.32 
 
 
102 aa  83.6  8e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  40.21 
 
 
105 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  40.4 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  33.01 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  37.76 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  36.84 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  34.95 
 
 
107 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  34.74 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  42.86 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  37 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  40.48 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  41.11 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  35.79 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  38 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  37.89 
 
 
109 aa  80.1  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  43.37 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  34.65 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  35.64 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  35.64 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  38.3 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  39.08 
 
 
114 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  35 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  36 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  34.65 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  36 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  36 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  36 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  33.01 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  39.6 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  39.18 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  37.11 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  39.18 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  35 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  37.62 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  39.29 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  32.97 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  39.56 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  36.56 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  33.01 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  39.18 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  35 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  33.01 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  35.92 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  33.01 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  39.56 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  39.56 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  37.76 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  40.24 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  43.37 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  35.42 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  37.63 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  39.56 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  36.56 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  37.89 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  35.42 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  36.84 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  38.46 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  36.56 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  38.1 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  37.62 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  37 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  36.56 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  36.56 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  40.7 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  34.41 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  37.36 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  37.62 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  33.67 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  40.45 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  77  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  39.53 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  37.36 
 
 
103 aa  76.6  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>