More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0177 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  100 
 
 
107 aa  221  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  76.24 
 
 
104 aa  169  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  57.84 
 
 
105 aa  127  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  54.9 
 
 
106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  51 
 
 
104 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  52.43 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 
104 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  48.86 
 
 
104 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  48.86 
 
 
104 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  48.86 
 
 
104 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  48.86 
 
 
104 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  48.86 
 
 
104 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  48.86 
 
 
104 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  47.73 
 
 
104 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  48.86 
 
 
104 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  48.86 
 
 
104 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  47.73 
 
 
104 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  46.43 
 
 
103 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  45.24 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  45.24 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  40.23 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  32.67 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  34.38 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  34.38 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  34.38 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  34.38 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  34.04 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  34.04 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1807  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.63 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.132216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  34.38 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  34.04 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  34.38 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  30 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  32.29 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2156  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2311  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0847  thioredoxin domain-containing protein  32.32 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00144466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0830  thioredoxin domain-containing protein  32.32 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0432193  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  38.03 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  38.03 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  40.23 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  36.84 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1625  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.57 
 
 
110 aa  57.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000722607  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.02 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  30 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  28.57 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  33.64 
 
 
338 aa  57  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  32.61 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  35.29 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  31.87 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  28.16 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  30.21 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  30.11 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  31.25 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  29.03 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  28.72 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  29.03 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  29.47 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  29.03 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  38.1 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  32.88 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  30.11 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  30.11 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  30.11 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  30.11 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  30.11 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  30.11 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  30.11 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  31.46 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  33.75 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  29.55 
 
 
272 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  26.32 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  29.55 
 
 
272 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  29.9 
 
 
169 aa  52.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  29.03 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01200  thioredoxin (trx), putative  27 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954839  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  32.58 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  29.03 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  29.03 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  29.03 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  29.03 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  32.47 
 
 
98 aa  52.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  29.03 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  29.03 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  29.35 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  32.05 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  30.21 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  27.78 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  27.08 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  30.21 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  27 
 
 
289 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  30.34 
 
 
109 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  34.78 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  27.06 
 
 
406 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  32.56 
 
 
277 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  29.67 
 
 
272 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  30 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  28.24 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>