More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0588 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  47.06 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  48.55 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  42.14 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  39.42 
 
 		 138 aa  116  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  40.5 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  48 
 
 		 238 aa  103  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  38.89 
 
 		 289 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  38.89 
 
 		 289 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  43.64 
 
 		 259 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  45.36 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  44 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  46.34 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  40 
 
 		 114 aa  94.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  36.22 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  31.97 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  44.23 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  41.67 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  42.42 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  43.81 
 
 		 259 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  48.35 
 
 		 257 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  40.95 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  45.36 
 
 		 109 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  44.33 
 
 		 110 aa  93.2  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  43.88 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  44.12 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  40.37 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  41.41 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  41.84 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  40.59 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  41.24 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  41.57 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  44 
 
 		 107 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  45 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  41.41 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  41.57 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  41.57 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  42 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  34.31 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  43.48 
 
 		 223 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  38.1 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  38.1 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  41.41 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  41.38 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  51.25 
 
 		 285 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  42.17 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  40.21 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  42 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  43.16 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  48.24 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  37.38 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  38.38 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  39.8 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  44.12 
 
 		 281 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  36.27 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  40.22 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  30.4 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  40.45 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  40.59 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  40.45 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  40.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  40.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  40.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  40.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  40.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  46.51 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  40.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  44.19 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  38 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  40.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  30.3 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  40.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  44.12 
 
 		 281 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  40.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  41.24 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  43.53 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  41.24 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  41.24 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  41.24 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  41.24 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  39.78 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  38.38 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  42.68 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  41.84 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  39.25 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  38.3 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  39.25 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  44.57 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  42.17 
 
 		 235 aa  86.7  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  40.23 
 
 		 109 aa  87  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  42.27 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  44.58 
 
 		 293 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  36.96 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  44.58 
 
 		 293 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  38.3 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  39.42 
 
 		 282 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  37.78 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>