More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3801 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 768 aa  1559    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  39.51 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  39.51 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  41.94 
 
 		 110 aa  81.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  43.37 
 
 		 104 aa  80.9  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  39.81 
 
 		 119 aa  80.9  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  39.56 
 
 		 98 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  33.33 
 
 		 165 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  39 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  42.53 
 
 		 109 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  39.53 
 
 		 269 aa  77  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  41.67 
 
 		 109 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  37.65 
 
 		 281 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  41.67 
 
 		 109 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  41.67 
 
 		 109 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  37.65 
 
 		 281 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  38 
 
 		 300 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  43.04 
 
 		 116 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  38.18 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  38.18 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  39.53 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  38.04 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  40.26 
 
 		 107 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  39.77 
 
 		 140 aa  74.3  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  40 
 
 		 142 aa  74.7  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  39.29 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  36.47 
 
 		 280 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  44.16 
 
 		 406 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  29.67 
 
 		 301 aa  73.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  35.79 
 
 		 282 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  37.65 
 
 		 302 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  43.04 
 
 		 102 aa  72.8  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  40.48 
 
 		 104 aa  73.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  40.96 
 
 		 91 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  41.25 
 
 		 105 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  37.65 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  36.79 
 
 		 140 aa  72  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  34.94 
 
 		 105 aa  72  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  38.36 
 
 		 128 aa  72  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  39.56 
 
 		 700 aa  71.6  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  34.29 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  35.63 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  36.89 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  41.56 
 
 		 98 aa  71.6  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  33 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  37.65 
 
 		 144 aa  71.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  33.33 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  39.47 
 
 		 104 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  33.65 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  41.25 
 
 		 103 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  35.4 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  33.33 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  40.96 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  37.8 
 
 		 106 aa  70.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  37.35 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  39.24 
 
 		 104 aa  70.1  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  39.08 
 
 		 286 aa  70.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  40.96 
 
 		 108 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  37.8 
 
 		 98 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  41.98 
 
 		 89 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  33.65 
 
 		 282 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  36.78 
 
 		 103 aa  70.1  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  41.03 
 
 		 297 aa  70.5  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  33.65 
 
 		 282 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  37.5 
 
 		 112 aa  69.3  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  36.89 
 
 		 147 aa  69.7  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  36.78 
 
 		 223 aa  70.1  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  41.56 
 
 		 105 aa  69.3  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  38.82 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  35.11 
 
 		 150 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  38.55 
 
 		 299 aa  69.7  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  36.47 
 
 		 282 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  30.32 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  31.33 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  35.29 
 
 		 302 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  39.13 
 
 		 285 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  36.14 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  39.13 
 
 		 285 aa  69.3  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  33.33 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  37.63 
 
 		 103 aa  68.9  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  40 
 
 		 141 aa  69.3  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  42.22 
 
 		 105 aa  69.3  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  42.25 
 
 		 105 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  38.1 
 
 		 109 aa  68.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  35.23 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  41.03 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  37.5 
 
 		 176 aa  68.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  40.91 
 
 		 109 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  35 
 
 		 136 aa  68.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  38.89 
 
 		 119 aa  68.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  36.47 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  36.47 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  38.75 
 
 		 90 aa  68.2  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  39.73 
 
 		 104 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  37.18 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  36.47 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  36.47 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  36.47 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  37.35 
 
 		 89 aa  68.2  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  38.75 
 
 		 102 aa  67.8  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>