More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3969 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  220  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  94.44 
 
 		 108 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  62.14 
 
 		 106 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  60.19 
 
 		 107 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  60.19 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  55.14 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  66.32 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  59.22 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  58.42 
 
 		 111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  58.42 
 
 		 111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  57.28 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  57.14 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  60.78 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  60.78 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  60.78 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  60.78 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  61.76 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  51.85 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  55.77 
 
 		 112 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  53.85 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  62.11 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  52.38 
 
 		 111 aa  124  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  54.46 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  53.19 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  51.65 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  53.06 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  57.83 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  52.58 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  30.68 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  32.95 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  31.03 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  31.71 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  30.48 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  31.46 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  27.91 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  36.14 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  35.63 
 
 		 406 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  38.89 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  36.14 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  36.76 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  29.55 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  31.58 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  27.18 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  30.3 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  32.39 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  30.68 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  35.29 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  35.29 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  35.29 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  35.29 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  35.21 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  27.91 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  29.69 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  32.95 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  27.14 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  34.18 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  28.09 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  31.11 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  30.99 
 
 		 768 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  33.33 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  31.03 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  30.23 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  31.03 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  32.41 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  31.18 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  31.87 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  28.42 
 
 		 138 aa  50.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  31.87 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  31.82 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  31.82 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  30.61 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  30.68 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  26.74 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  28.57 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  32.53 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  28.16 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  30.34 
 
 		 259 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  27.47 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  26.32 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  23.91 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  32.58 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  29.21 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  28.16 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  28.16 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  29.7 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  28.38 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  35 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  32.1 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  32.14 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  26.6 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  33.85 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  27.06 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  31.71 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>