73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3300 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  276  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  90.74 
 
 		 161 aa  201  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  200  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  200  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  200  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  88.89 
 
 		 108 aa  197  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  87.04 
 
 		 108 aa  196  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  80.37 
 
 		 108 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  80.37 
 
 		 108 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  80.37 
 
 		 108 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  80.37 
 
 		 108 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  66 
 
 		 107 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  61.68 
 
 		 106 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  60.61 
 
 		 106 aa  140  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  59.26 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  61.62 
 
 		 108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  61.39 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  62.11 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  62.11 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  59.57 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  54.9 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  58.25 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  59.57 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  52.53 
 
 		 112 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  56.38 
 
 		 111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  52.69 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  46.09 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  58.51 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  56.38 
 
 		 111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  53.41 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  47.31 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  46.81 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  55.68 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  48.31 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  36.25 
 
 		 768 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  34.92 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  36.84 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  33.85 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  35.38 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  33.85 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  31.51 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  36.71 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  32.31 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  33.85 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  33.85 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  30.23 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  25.53 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  29.89 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  26.32 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  31.65 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  34.21 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  25.93 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  33.71 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  30.23 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  32.97 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  33.71 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  30.51 
 
 		 123 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  35.94 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  25 
 
 		 107 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  29.33 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  32.91 
 
 		 134 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  32.91 
 
 		 406 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  33.33 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  30.38 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  29.69 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  31.25 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  28.12 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  28.17 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  30.3 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  30.67 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  27.5 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  32.39 
 
 		 111 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>