More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2109 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  100 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  97.71 
 
 		 131 aa  259  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  84.73 
 
 		 131 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  62.41 
 
 		 133 aa  175  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  60.63 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  51.49 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  58.56 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  53.38 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  48 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  54.29 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  49.24 
 
 		 137 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  45.54 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  42.57 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  42.57 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  38.61 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  38.78 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  36.29 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  36.57 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  37.08 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  33.33 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  35.4 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  36.78 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.71 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  35.42 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  33.7 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  38.04 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  35.05 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  39.53 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  32.95 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  30.89 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  34.72 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  34.72 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  29.81 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  32.95 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  29.81 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  29.81 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  29.81 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.14 
 
 		 591 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2699  hypothetical protein  31.07 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.752248  normal  0.95021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  40 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.32 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  36.78 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  35 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  31.31 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  36.11 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  28.42 
 
 		 338 aa  52.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  32.5 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  39.19 
 
 		 406 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  37.78 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  32.58 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  37.78 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  34.31 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  34.17 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  32.58 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  37.78 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  30 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  35.56 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  33 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  32.94 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  34.25 
 
 		 176 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  25.78 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  40.28 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  32.18 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  31.2 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0946  thioredoxin  37.63 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  29.63 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.72 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  28.04 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  33 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  30.86 
 
 		 105 aa  50.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  34.74 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  31 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  31 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  30.77 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  34.09 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  30.51 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  33.33 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  34.62 
 
 		 290 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 		 222 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  30.59 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  30.39 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  28.85 
 
 		 150 aa  50.1  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  29.7 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  30.51 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  34.07 
 
 		 290 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  31.82 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  35.58 
 
 		 286 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  30.69 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  34.44 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  32.04 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  33.68 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  33.68 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  30.69 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  34.72 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  31.31 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  34.48 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  27.1 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  31.03 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>