239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3183 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  100 
 
 		 138 aa  280  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  59.42 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  60.63 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  59.06 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  51.09 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  59.84 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  57.43 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  46.72 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  42.86 
 
 		 134 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  51.46 
 
 		 133 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  44.85 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  39.09 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  39.09 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  36.27 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  37.5 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  33.66 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  35.29 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  32.14 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  31.91 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  30.08 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  31.58 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  32.99 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  28.12 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  41.82 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  37.33 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  30.95 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  35.29 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  30.7 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  34.09 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  34.09 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3418  thioredoxin-like protein  42.11 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  29.59 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  30.11 
 
 		 338 aa  50.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  31.58 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  33 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  32 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  36.47 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  29.67 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  32 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  27.36 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2699  hypothetical protein  29.7 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.752248  normal  0.95021 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  27.72 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  28.57 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.99 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  32 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  32.91 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  26.89 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  32.65 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  30.56 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  32.91 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  32.91 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  27.97 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  32.14 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  31.4 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  33.33 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  32.14 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  33.33 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  27.08 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  29.25 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  28.8 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2519  Rhodanese domain protein  29.35 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  34.52 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  33.33 
 
 		 421 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  27.87 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  29.41 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  36.36 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  29.9 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  28 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3124  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.9 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  31.03 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  26.73 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2606  putative thioredoxin-like protein  30.1 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.888104  normal  0.656305 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  27.34 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  29.7 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  32.22 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  30.69 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  35.9 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  31.82 
 
 		 406 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  27.34 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  29.29 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  28 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  29.76 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  28.71 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  31.33 
 
 		 229 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  28.95 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  29.59 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  28.71 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  29.35 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  31.03 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  26.61 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  30.21 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  26.26 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  30.39 
 
 		 326 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  31.76 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  25.96 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  28.24 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  28.24 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  28.24 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  28.04 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  28.87 
 
 		 107 aa  43.5  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>