44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2699 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2699  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  253  6e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.752248  normal  0.95021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  30.77 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  25.71 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  29.91 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  30.4 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.23 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  31.91 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  27.45 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  34.19 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  25.44 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  30.77 
 
 		 191 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  32.29 
 
 		 238 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.26 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.04 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  24.49 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  34.78 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  25.74 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  31.51 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  31.4 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  33.8 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1247  thioredoxin  35.06 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000845354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  28 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  32.5 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.57 
 
 		 380 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  25.93 
 
 		 196 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  28.75 
 
 		 113 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  25 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  29.7 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  25 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  25 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  25 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  35.48 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  31.33 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  31.4 
 
 		 237 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  26.56 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  32.14 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  25.24 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  25.42 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.11 
 
 		 203 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  31.11 
 
 		 259 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  28.41 
 
 		 107 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  28.41 
 
 		 107 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  28.57 
 
 		 110 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>