More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2722 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  271  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  53.73 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  57.14 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  50.38 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  57.14 
 
 		 135 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  47.06 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  50.38 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  56.59 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  45.11 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  45.11 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  47.45 
 
 		 138 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  50.38 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  43.8 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  35.64 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  38.61 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  40.98 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  36.76 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  32.65 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  33.03 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  37.23 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  30.43 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  31.37 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  34.02 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  30.1 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  34.69 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  31.03 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  34.69 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  30 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  30.53 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  29.89 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  32.61 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  34.83 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  32.71 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  32.14 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  30.21 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  33.33 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  35.63 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  33 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  30.68 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  30.34 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  28.87 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  31.03 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  35.42 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  31.63 
 
 		 160 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3418  thioredoxin-like protein  42.62 
 
 		 166 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  30.3 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  34.12 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  29 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  32.63 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  31.76 
 
 		 289 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  30.69 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  30.53 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  31.33 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2699  hypothetical protein  27.45 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.752248  normal  0.95021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  28.41 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  31.82 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  31.76 
 
 		 289 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  30.3 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  29.67 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  32.41 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.58 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  32.08 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  30.69 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  31.58 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  29 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 		 222 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  31.78 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  32.08 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  30.95 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  28.28 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  31.82 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  27 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  27.88 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  27.72 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  29.7 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  29.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  29.07 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  28.74 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  36.14 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  26.53 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  30.3 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  28.85 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  31.25 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  35.71 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  35.71 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  26 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  29.13 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  31.03 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  27.66 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  36.11 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  31.31 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  31.31 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0850  Thioredoxin domain protein  28.05 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  30.12 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  36.11 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  33.72 
 
 		 269 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  34.09 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>