More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2976 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  270  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  62.41 
 
 		 131 aa  175  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  61.65 
 
 		 131 aa  174  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  59.42 
 
 		 138 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  61.65 
 
 		 131 aa  153  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  54.14 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  56.76 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  52.63 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  51.38 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  45.9 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  45.9 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  48.57 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  48.65 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  43.14 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  39.45 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  42.2 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  38.46 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  33.09 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  39.73 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  33.03 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  33.72 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  30.77 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  40.26 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  30.69 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  38.37 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  38.37 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  36.84 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  33.66 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  39.53 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  30.39 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  28.07 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  32.67 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  35.63 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  31.52 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  31.52 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  31.52 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  31.52 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  31.52 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  31.52 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  31.52 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  31.52 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  31.52 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  31.52 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  34.67 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  31.52 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  35.16 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  33.33 
 
 		 406 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  32.63 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  25.98 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  30.69 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  36.25 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  31.4 
 
 		 421 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  36.84 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  34.48 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  37.76 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  38.37 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  32.65 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  34.88 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  29.67 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  36.05 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  36.05 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  31.58 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  36.05 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  31.87 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.87 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  27.37 
 
 		 338 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  38.37 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  33.67 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  28.89 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  33.8 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf030  thioredoxin family member  31.25 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  34.33 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  31.03 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  29.7 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  33.8 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  29.41 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf029  thioredoxin family member  30.59 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  35.71 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  36.05 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7608  predicted protein  33.82 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  30.48 
 
 		 238 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  27.88 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  31.76 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  29.07 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  29.07 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  29.07 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  35.9 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  29.07 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  31.52 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  34.07 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  34.07 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  31.87 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  34.07 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  34.07 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  34.07 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  34.07 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  34.07 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>