More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf030 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf030  thioredoxin family member  100 
 
 
99 aa  207  4e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf029  thioredoxin family member  85.86 
 
 
99 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  41.46 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  41.46 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  32.65 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  32.65 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  32.65 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  36.14 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  35.63 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  37.04 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  34.94 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  31.31 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  41.56 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  37.63 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  34.65 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  31.18 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  34.21 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  34.57 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  34.52 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  30.61 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  31.96 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  37.04 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  34.04 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  37.33 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  35.8 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  33.71 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  36.36 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  39.19 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  35.63 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  35.8 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  34.04 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  40.28 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  30.68 
 
 
189 aa  60.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  36.36 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  32.43 
 
 
100 aa  60.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  34.48 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  34.62 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  30.53 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  33.01 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  36.71 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  36.25 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  34.62 
 
 
106 aa  60.1  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  35.37 
 
 
106 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  36.99 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  32.98 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  35.71 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  35.11 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  37.18 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  35.71 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  28.09 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  34.15 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  32.5 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  34.21 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.63 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  38.67 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  31.18 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  35 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  28.87 
 
 
107 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  34.21 
 
 
107 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  35.9 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  31.96 
 
 
102 aa  58.2  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  34.48 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  33.73 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  34.69 
 
 
107 aa  58.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  36.84 
 
 
110 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  30 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  35.53 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  32.98 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  39.73 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  32.53 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  32.04 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  32.04 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  32.98 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  30 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  31.58 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  35.9 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  32.98 
 
 
106 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  34.21 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  34.21 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  34.21 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  32.89 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  31.65 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  31 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  34.21 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  38.89 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  36.71 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  34.07 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  36.36 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  29.7 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  42.25 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  31.58 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  34.18 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  31.58 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  32.95 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  32.47 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  31.58 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  28.71 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>