More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf029 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf029  thioredoxin family member  100 
 
 
99 aa  207  3e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf030  thioredoxin family member  85.86 
 
 
99 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  37.11 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  32.65 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  35.64 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  33.67 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  33.67 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  32.65 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  35.05 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  38.27 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  36.63 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  36.78 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  39.02 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  35.42 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  31.58 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  30.69 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  36.17 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  40 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  36.14 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  38.27 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  40.28 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  34.38 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  34.48 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  33.71 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  33.73 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  30.68 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  35.42 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  35.9 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  35.9 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  35.53 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  38.16 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  34.04 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  32.98 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  36.36 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  35 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  36.36 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  38.46 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  30.34 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  32.26 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  37.97 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  33.72 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  34.48 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  38.89 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  30.21 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  30.93 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  35.44 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  35.8 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  39.19 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  37.8 
 
 
100 aa  61.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  35.53 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  39.47 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  32.67 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  34.94 
 
 
130 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  33.33 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  36.71 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  35.48 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  36.99 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  35.53 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  30 
 
 
108 aa  60.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  36.25 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  40.28 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  30.21 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  34.62 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  31.25 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  39.47 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  32.65 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  39.73 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  36.84 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  34.57 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  34.57 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  29.7 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  34.21 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  31.33 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  34.21 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  34.21 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  36.49 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  34.21 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  29.7 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  43.08 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  37.18 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  32.98 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  33.82 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  34.21 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  33.77 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  32.89 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  30.3 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  34.57 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  39.73 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  36.84 
 
 
107 aa  58.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  38.96 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>