276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2560 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  55.3 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  52.63 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  53.38 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  52.63 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  46.72 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  49.62 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  46.56 
 
 		 135 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  43.65 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  45.71 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  42.19 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  42.19 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  45.45 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  36.27 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  40.86 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  33.07 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  39.45 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  33.58 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  34.25 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  30.6 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  34.52 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  32.94 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  30.33 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  32.93 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  30.68 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  35.56 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  33.71 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  30.21 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  32.1 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  32.1 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  34.74 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  31.33 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  35.63 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  37.5 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  29.52 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  28.41 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  35.71 
 
 		 105 aa  48.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  35.63 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  36.11 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  34.21 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  30.93 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  35.63 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  36.11 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  29.89 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  37.21 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  32.18 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  31.82 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2375  thioredoxin-related  28.57 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  35.16 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  30.59 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  35.53 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  27.66 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  27.66 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  28.74 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  34.25 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  34.72 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  28.87 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  31.4 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  30.23 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  29.07 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  27.68 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  30.86 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2699  hypothetical protein  26 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.752248  normal  0.95021 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  29.21 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  30.86 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  28.74 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  25.45 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  27.96 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  32.61 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  28.42 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  30.38 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  35.29 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7608  predicted protein  33.75 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  28.89 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  29.25 
 
 		 603 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  34.85 
 
 		 597 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  26.13 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  32.14 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  28.92 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  25.45 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  32.98 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  29.11 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  31.68 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  32.22 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  28.89 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  25.26 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  29.52 
 
 		 517 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  29.41 
 
 		 421 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  29.63 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  34.21 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  25.26 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  33.33 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2785  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.07 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3418  thioredoxin-like protein  40 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  29.55 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  32.29 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  24.53 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>